FORTRAN在科学计算领域建立了长达数十年的统治地位。其主要应用领域包括：

1. 天气预报：欧洲中期天气预报中心（ECMWF）的集成预报系统（IFS）核心代码使用FORTRAN编写。全球多个国家的气象中心仍然依赖FORTRAN代码。

2. 计算流体力学：NASA的多个流体动力学模拟程序使用FORTRAN，包括用于航天器设计的OVERFLOW代码。

3. 分子动力学：著名的分子动力学模拟软件GROMACS、AMBER、NAMD的核心计算引擎均使用FORTRAN或C++编写，其中FORTRAN占很大比例。

4. 核物理与高能物理：CERN的粒子物理模拟框架Geant4虽然使用C++，但其前身Geant3使用FORTRAN。许多核反应堆模拟程序仍使用FORTRAN。

5. 线性代数库：LAPACK（Linear Algebra PACKage）和BLAS（Basic Linear Algebra Subprograms）这两个几乎所有科学计算软件都依赖的基础库，完全使用FORTRAN编写。